M. A. Raphael Ndiaye est diplômé en philosophie (Paris I Panthéon Sorbonne 1971), bibliothéconomie (Ecole nationale supérieure des Bibliothécaires, ENSB, Paris 1972) et ethnolinguistique (Paris III Sorbonne Nouvelle, 1981). Il a également suivi stage de formation en édition à Paris (1986).

Il a été directeur des Archives culturelles du Sénégal (archives audiovisuelles sur les traditions orales de tous les groupes ethniques du pays 1975 - 1981), directeur des bibliothèques publiques de son pays (1977 – 1987), et président de diverses associations de bibliothécaires (1975 – 1987)
Homme de radio, il a créé et animé deux émissions sur les ondes de Radio Sénégal international : « La tradition orale d’hier à demain », une demi-heure hebdomadaire, de décembre 1976 à décembre 1980, et « Espace livre », une émission hebdomadaire pour la promotion du livre et de la lecture, 45 mn puis 30 mn, d’octobre 1987 à mars 2016).
Il a été enseignant à l’école des bibliothécaires archivistes et documentalistes de Dakar (de 1975 à 1987) et a coordonné le secteur de la communication à Enda Tiers Monde (de 1987 à 2010) avant de suivre l’atelier de formation de formateurs sur la Convention de 2003.
Depuis 2013, il est le Directeur général de la Fondation Léopold Sédar Senghor à Dakar.
Il a participé à plusieurs projets de recherche en Afrique de l’Ouest et publié plusieurs ouvrages à caractère culturel (dont les deux derniers en 2020 : Lutteur de légende, un long poème de 588 vers, et La Parole chez les Seereer Anthropologie et langage, 334 pages).